Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RFTN1Q14699 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RFTN1Q14699 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RFTN1Q14699 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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