Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PEX6Q13608 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PEX6Q13608 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PEX6Q13608 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PEX6Q13608 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PEX6Q13608 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PEX6Q13608 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX6Q13608 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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