Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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C1orf61Q13536 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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C1orf61Q13536 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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C1orf61Q13536 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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C1orf61Q13536 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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C1orf61Q13536 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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