Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CALCOCO2Q13137 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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CALCOCO2Q13137 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CALCOCO2Q13137 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CALCOCO2Q13137 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CALCOCO2Q13137 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CALCOCO2Q13137 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CALCOCO2Q13137 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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