Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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TRAF1Q13077 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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TRAF1Q13077 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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TRAF1Q13077 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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TRAF1Q13077 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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TRAF1Q13077 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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