Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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