Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms