Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.4 ms