Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ZNF85Q03923 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms