Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGP37231 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGP37231 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGP37231 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGP37231 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGP37231 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGP37231 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGP37231 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGP37231 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGP37231 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PPARGP37231 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PPARGP37231 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms