Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR1P32246 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR1P32246 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR1P32246 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR1P32246 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR1P32246 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR1P32246 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR1P32246 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR1P32246 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR1P32246 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCR1P32246 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms