Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms