Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms