Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AMD1P17707 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AMD1P17707 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
AMD1P17707 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AMD1P17707 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMD1P17707 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMD1P17707 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AMD1P17707 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AMD1P17707 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AMD1P17707 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AMD1P17707 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AMD1P17707 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AMD1P17707 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AMD1P17707 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AMD1P17707 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AMD1P17707 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AMD1P17707 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AMD1P17707 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AMD1P17707 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AMD1P17707 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AMD1P17707 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AMD1P17707 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AMD1P17707 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AMD1P17707 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms