Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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