Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUX2O14529 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUX2O14529 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUX2O14529 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUX2O14529 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CUX2O14529 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUX2O14529 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUX2O14529 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CUX2O14529 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CUX2O14529 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CUX2O14529 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CUX2O14529 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CUX2O14529 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CUX2O14529 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CUX2O14529 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CUX2O14529 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CUX2O14529 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CUX2O14529 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CUX2O14529 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CUX2O14529 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CUX2O14529 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CUX2O14529 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CUX2O14529 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CUX2O14529 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CUX2O14529 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CUX2O14529 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CUX2O14529 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUX2O14529 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUX2O14529 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUX2O14529 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUX2O14529 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUX2O14529 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUX2O14529 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUX2O14529 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CUX2O14529 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUX2O14529 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUX2O14529 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUX2O14529 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUX2O14529 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUX2O14529 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUX2O14529 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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