Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms