Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAN1Q9Y2M0 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms