Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZCCHC17Q9NP64 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZCCHC17Q9NP64 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms