Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRIM8Q9BZR9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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