Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKD2Q9BZL6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms