Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF4BQ92750 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms