Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FBXO39Q8N4B4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms