Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX04

CWC27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC27Q6UX04 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CWC27Q6UX04 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms