Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMBR1LQ6UX01 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms