Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GREB1Q4ZG55 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GREB1Q4ZG55 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms