Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PDCD2Q16342 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDCD2Q16342 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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