Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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