Protein–RNA interactions for Protein: Q13371

PDCL, Phosducin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCLQ13371 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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