Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STRN3Q13033 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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