Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms