Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms