Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SYCNQ0VAF6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms