Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPN11Q06124 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms