Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms