Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms