Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PGGT1BP53609 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PGGT1BP53609 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PGGT1BP53609 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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