Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD4P46934 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms