Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2BP42772 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms