Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF4P34130 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms