Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-FP30511 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-FP30511 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-FP30511 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-FP30511 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-FP30511 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-FP30511 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-FP30511 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-FP30511 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-FP30511 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-FP30511 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-FP30511 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-FP30511 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-FP30511 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-FP30511 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-FP30511 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-FP30511 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-FP30511 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-FP30511 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-FP30511 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms