Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms