Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP2AP11388 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms