Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms