Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDN1P05305 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDN1P05305 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDN1P05305 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDN1P05305 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDN1P05305 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDN1P05305 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDN1P05305 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EDN1P05305 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDN1P05305 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDN1P05305 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDN1P05305 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDN1P05305 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDN1P05305 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDN1P05305 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms