Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNB1P01574 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms