Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TIMM17BO60830 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms