Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGSF9BQ9UPX0 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms