Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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COPS3Q9UNS2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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COPS3Q9UNS2 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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COPS3Q9UNS2 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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COPS3Q9UNS2 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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