Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO1Q9P1Z2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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